Vào đầu những năm 2050, các dạng sống không xác định được gọi là “tế bào Tiên tri” bắt đầu tiêu thụ không kiểm soát tất cả sự sống trên Trái đất. Sự thèm ăn và khả năng thích ứng đáng kinh ngạc của chúng khiến chúng khiếp sợ đầu tiên, sau đó là kính sợ và cuối cùng là cái tên “aragami”. Đối mặt với kẻ thù hoàn toàn miễn nhiễm với vũ khí thông thường, nền văn minh đô thị sụp đổ, và mỗi ngày loài người càng ngày càng bị đẩy đến chỗ tuyệt chủng. Một tia hy vọng duy nhất vẫn còn cho nhân loại. Sau sự phát triển của “God Arcs”—vũ khí sống kết hợp các tế bào Oracle—những người sử dụng chúng được tổ chức thành một lực lượng tinh nhuệ.
Một người con trai bị mất trí nhớ được Eruruu cứu sống và trở thành một phần trong gia đình của cô. Được đặt cho cái tên Hakuoro, anh trở thành lãnh đạo của quân khởi nghĩa chống lại Inkara – một tên lãnh chúa ác ôn, và lập nên đất nước của riêng mình. Câu chuyện xoay quanh quá trình lập nước và giữ nước của anh, đi đôi với quá trình tìm lại phần trí nhớ bị mất.