Trong Cặp Đôi Vượt Thời Gian, Son Ho Jun và Jang Na Ra đóng vai một cặp đôi 40 tuổi không ưa nhau, và đang vật lộn với cuộc sống nhiều bất đồng của họ. Một ngày, họ thức dậy và thấy mình đã quay ngược thời gian trở lại thời điểm khi cả hai đều 20 tuổi. Những tia lửa tình yêu giữa họ nhen nhóm lại, và họ bắt đầu sống cuộc sống của tuổi trẻ mà họ đã bỏ lỡ lần đầu tiên.
Bộ phim kể lại câu chuyện về các sự kiện văn hóa nổi bật ở Hàn Quốc năm 1994, với sự xuất hiện của ban nhạc idol đầu tiên của K-pop, ‘Seo Taiji and Boys‘, và đội bóng rổ của Đại Hàn Dân quốc. Ba chàng trai từ tỉnh Gyungsang thuê nhà trọ cùng nhau khi lên học đại học ở Seoul. Tại đây, họ gặp gỡ cô con gái của chủ nhà trọ, Na Sung (Go Ah Ra). Và câu chuyện mới của chúng ta chính thức được bắt đầu...